В дореволюционном Омске насчитывалось 9 паровых мельниц, самой крупной мельницей сортового помола была мельница купца I гильдии Колокольникова, на базе которой существует комбинат.

Старый корпус мельницы был построен в 1905 году и просуществовал до 1944 года. Новый 6-этажный корпус был построен в 1914 году и пущен в эксплуатацию после монтажа оборудования в 1931 году.

Старая мельница многосортового помола работала на немецком оборудовании. Она не имела средств механизации на транспортировке зерна и готовой продукции, вместо транспортеров работали грузчики и лошади.

С 1905 по 1944 гг старая паровая мельница в зависимости от многих условий, работала на разных помолах: пшенице, ржи, горохе, ячмене, овсе и даже перерабатывала черёмуху.

В 1944 г. технологическое оборудование старой линии было демонтировано и вывезено на запад для восстановления разрушенного во время Великой Отечественной войны хозяйства.

С развитием индустриализации мельница из года в год преобразовывалась, обновлялось технологическое оборудование, внедрялись средства механизации, в результате перестали использовать лошадей, облегчились погрузочно-разгрузочные работы.

В 1944 г. технологическое оборудование старой линии было демонтировано и вывезено на запад для восстановления разрушенного во время Великой Отечественной войны хозяйства.

С 1971 г. началась крупная перестройка на мельнице. В 1973 году построена и сдана в эксплуатацию котельная на жидком топливе с тремя котлами. В 1974 году начато строительство первой очереди элеватора сборной конструкции, в 1976 году запущена и сдана в эксплуатацию вторая очередь элеватора. В 1986 году была проведена большая реконструкция: были реконструированы бункера для равномерного поточного отволаживания и проведена перекомпоновка оборудования зерноочистительного отделения.

В 1990-1999 года была проведена реконструкция здания мельницы и замена устаревшего технологического оборудования на более современное высокопроизводительное оборудование швейцарской фирмы "BULLER". Производительность мельницы составляет 500 тонн зерна в сутки с выходом сортовой муки – 75%. В результате технического перевооружения, повысилось качество муки, она соответствует требованиям ГОСТа и мировым стандартам. Технологическая схема производства муки позволяет регулировать выход и ассортимент в зависимости от требований рынка.

На оборудовании, освободившемся после реконструкции, произведен монтаж линии по производству ржаной муки мощностью 50 тонн зерна в сутки. В 1994 г. хлебокомбинат был преобразован в акционерное общество «Мельница». В 2005 году начато производство гранулированных кормопродуктов, организован цех фасовки круп.